明朝在于1644年被李自成攻破之后，剩下地位残余势力立马转战江南。虽然大明失去北京，失去了北方大片国土，但身处南方的大片土地依然掌握在他们手里，依然有翻盘的机会。于是明朝的宗室子弟们在江南建立了一个又一个的政权。而伴随着李自成42天皇帝梦的覆灭，当年占据北方大片领土的农民军们，这个时候不得不选择和南明政权合作，毕竟他们需要一个领导者。毕竟大家面对的外敌过于强悍。也正是清朝的介入，农民军和南明终于找到了共同语言，不断着抗击清军的入侵。

这次合作前后持续了近40年，也就是史书上所说的南明时期。当然，这是历史上很笼统的说法，但事实上，南明政权和农民军残部的合作并不是很愉快，甚至可以说是烂透了。而之所以会是这个样子，主要原因还是出在南明身上。因为从南明建立起来的那一刻起，他们就对农民军带有深深的偏见。虽然自己本身就已经烂透了，江北四镇不战而降多达三个，但哪怕再烂，他们也要弄死农民军，这点上可以说堪称奇葩了，就好比玩一品官老爷或者麻雀飞青天一样，明知道打不赢对面，却硬要死命打，不是自己找死吗。比如在南京被拥立为“弘光”帝的福王朱由崧，执行的就是采取了“联虏平寇”的策略。

而所谓“联虏平寇”，就是就是联合清廷，荡平李自成、张献忠等农民军。简直是滑天下之大稽。这种情况一直到了南明在位时间最长，也是最后一位是永历帝上来之后才有所改变。永历朝廷觉得这样一直被清朝撵着打，长久下去定要灭亡的，而敌人的敌人，那就是朋友。于是永历皇帝决定“招安”农民军残部，和农民军合作共同抗清。首先就是大顺军，李自成死后，大顺军群龙无首，被清军追着打，但他们依然坚持抗清。可是打仗这事吧，没组织是不行的，靠单打独斗坚持不了多久，于是乎面对南明的“邀请”，他们欣然接受。永历政权在抗清斗争中曾取得不错的成绩，差一点就成中兴之像。但是，永历皇帝的想法很不错，可行动起来却不是这么一回事。本来刚去 25404398645

联合起来的新永历大军很牛鬼，他们向清军发起数次反攻，连续取得了多次胜利，全国各地的抗清运动一时进入高潮。随后收复川、滇、黔、湘、粤、桂、赣七省，如果局势继续好转，永历帝将永载史册成为中兴大明的伟大君主。结果永历朝廷的内斗把农民军给排挤了出去，气的郝摇旗等人撤军回湖北，与永历朝廷彻底划清界限。清军趁机扩大了战果，又把永历帝赶到了西南。 身处绝境的永历帝命还是不错的，很快就接到了大西军在孙可望、李定国伸出的橄榄枝，要求永历接受他们的“投诚”。

之后李定国更是打出“两阙名王，天下震动”的丰功伟绩，本来这个时候永历皇帝真的就可以翻天了，结果，孙可望看不起农民军，闹分家跑去投降清军了。而之所以会是这个样子，其实道理很简单。在南明政权看来，大明王朝之所以会覆灭，祸根就是李自成、张献忠农民军。正是李自成、张献忠农民军给了大明王朝致命一击，导致崇祯帝死于非命，导致清军入关，导致明朝宗室到处逃命。

所以，南明对李自成、张献忠农民军恨之入骨，意欲置之死地而后快。但人家死不死没关系，结果也把自己玩死了，何必呢。